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第676章 努力的回报（第2页）

我们不仅是在和国际同行赛跑，也是在和国家内部的其他重要领域赛跑，在用掉本该属于他们的资源。

我们拿出的成果，必须十倍、百倍于我们消耗的这些算力，才能对得起这份压力和期待。”

罗伯特教授闻言，神色也凝重了许多，他望向机房的方向，喃喃道：“我现在感觉，这些计算周期，每一个都重若千钧。”

攻关小组的成员们几乎住在了机房，靠着浓咖啡和一股不服输的劲头，一个又一个地攻克技术难关。

陆时羡虽然没有亲自编写每一行代码，但他始终坐镇指挥。

他对计算机科学的了解的确没有其他学科深入，但拥有的深厚交叉学科背景，能够帮助团队理解生物学问题的本质，确保计算优化的方向始终服务于最终的科学目标，而不是陷入纯粹追求计算性能的误区。

比如他会指着某个模拟结果问：“这个构象的能垒是否合理？”

或者看着网络模型的输出说：“这个节点的连接度异常偏高，是需要优化的计算伪影，还是它真的提示了一个我们忽略的生物学关键点？”

辛勤的汗水终于换来了回报。

当经过深度优化的程序开始在“神威”

上稳定运行，海量的计算任务以前所未有的速度完成时，惊喜开始不断涌现。

第一个发现是SFR-1的“双面人格”

。

在之前基于“鸿蒙”

的、时间尺度较短的模拟中，SFR-1被认为主要与激活状态的GpcR相互作用。

但在“神威”

上进行的、长达微秒级的高精度分子动力学模拟中，团队惊讶地发现，SFR-1的某个特定结构域，在特定的膜脂环境和小分子配体，可能是细胞内未知的第二信使存在的条件下，会表现出一种奇特的“双面性”

。

即它既能与激活态的GpcR结合，也能以一种不同的构象，与某些处于“预备”

或“失活”

状态的GpcR发生弱相互作用。

“这暗示SFR-1可能不仅仅是一个被动的‘连接器’，它本身可能参与了对GpcR状态的‘感知’和‘选择’，就像一个智能开关，能判断哪些信号值得放大和传递。”

罗伯特教授看到这个结果时，激动地指着屏幕上的动态轨迹说道。

第二个发现是“孤儿domain”

的潜在功能。

埃琳娜团队提供的更高分辨率的冷冻电镜结构，结合“神威”

上运行的、更复杂的柔性拟合和分子动力学模拟，为那个功能未知的“孤儿domain”

提供了全新的线索。

模拟显示，这个domain并非刚性结构，而是一个高度动态的、富含带电氨基酸的“触手”

。

在模拟中，它表现出与多种不同SNARE蛋白组分相互作用的倾向，但其结合强度和特异性，似乎受到SFR-1其他区域构象的变构调控。

当SFR-1与GpcR结合后，这个‘触手’的构象熵明显降低了，变得更加有序，这很可能增强了它与特定SNARE蛋白的结合能力！